Utilisation des banques de séquences
pour la recherche taxinomique en phytovirologie et application
de l'analyse factorielle des corrrespondances a la classification
des Géminivirus.
Dominique DESBOIS, C. FAUQUET, D.FARGETTE, G.VIDAL. La revue MODULAD, numéro
9, juin 1992.
Résumé
Cet
article présente un exemple d’utilisation des
banques de données moléculaires, comme source d’information,
et de l’analyse factorielle des correspondances, comme
technique d’analyse, pour la recherche taxinomique, ceci
dans un pays en développement. L’application de
cette technique statistique multivariée à la classification
des virus de plantes permet de dégager des critères
taxinomiques cohérents basés sur la composition
en acides aminés, dinucléotides et codons de la
protéine capsidaire. Ces critères aboutissent à une
typologie pertinente du groupe des géminivirus, issue
d’un algorithme ascendant de classification hiérarchique.
Des références bibliographiques ainsi qu’une
liste d’adresses (postales, téléphoniques,
télex, fac-similés et électroniques) permettront
au lecteur de compléter aisément sa documentation
sur une banque de séquences, un logiciel d’analyse
ou un service télématique particulier.
Mots clés
Banques de données moléculaires,
Analyse statistique multivariée (Analyse factorielle des
correspondances, Classification ascendante hiérarchique),
Application à la phytovirologie (Taxinomie du groupe des
géminivirus), Services télématiques, Ressources
informatiques dans un pays en développement francophone.
Article
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