Estimation
des titres viraux : une programmation pratique et fiable sur
calculatrice de poche, et accessible par l'Internet.
Jocelyne
HUSSON van VLIET, Philippe ROUSSEL. La revue MODULAD,
numéro 34, juillet
2006
Résumé
Les auteurs proposent une méthode basée
sur la procédure
itérative de Newton-Raphson pour estimer la concentration
des suspensions virales à partir des résultats des
essais par effet cytopathique « tout-ou-rien » liés à la
courbe dose-réponse. La procédure de calcul fournit
l’estimation du maximum de vraisemblance avec ses limites
de confiance à 95% et détermine la valeur de Chi-2
pour tester la qualité de l’ajustement. Un programme
est présenté (calculatrices HP des séries
41 et 48). Il convient pour les conditions expérimentales
les plus variées et est également à présent
accessible librement sur le site Internet créé.
Abstract
A
method for estimation of viral suspension concentrations from
the dose-response data yielded by cytopathic effect assays is
presented. The maximum likelihood equation valid for such data
is solved using a robust implementation of the Newton-Raphson
iterative procedure. The method also provides 95% confidence
bounds on the concentration and the Chi-2 statistic for testing
the goodness
of fit. Programs for the HP41 and HP48 series handheld scientific
calculators suitable to most experimental situations are proposed.
The software is now also freely downloadable from an Internet
webpage.
Mots clés
Estimation des concentrations
virales; titre viral cytopathique tout-ou-rien; Maximum de vraisemblance;
loi de Poisson, essai de dénombrement par la méthode
des dilutions, estimation du nombre le plus probable.
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