Le Monde des Utilisateurs de L'Analyse de Données

Numéro 34

 
 

Estimation des titres viraux : une programmation pratique et fiable sur calculatrice de poche, et accessible par l'Internet.
Jocelyne HUSSON van VLIET, Philippe ROUSSEL
. La revue MODULAD, numéro 34, juillet 2006

Résumé

Les auteurs proposent une méthode basée sur la procédure itérative de Newton-Raphson pour estimer la concentration des suspensions virales à partir des résultats des essais par effet cytopathique « tout-ou-rien » liés à la courbe dose-réponse. La procédure de calcul fournit l’estimation du maximum de vraisemblance avec ses limites de confiance à 95% et détermine la valeur de Chi-2 pour tester la qualité de l’ajustement. Un programme est présenté (calculatrices HP des séries 41 et 48). Il convient pour les conditions expérimentales les plus variées et est également à présent accessible librement sur le site Internet créé.

Abstract

A method for estimation of viral suspension concentrations from the dose-response data yielded by cytopathic effect assays is presented. The maximum likelihood equation valid for such data is solved using a robust implementation of the Newton-Raphson iterative procedure. The method also provides 95% confidence bounds on the concentration and the Chi-2 statistic for testing the goodness of fit. Programs for the HP41 and HP48 series handheld scientific calculators suitable to most experimental situations are proposed. The software is now also freely downloadable from an Internet webpage.

Mots clés

Estimation des concentrations virales; titre viral cytopathique tout-ou-rien; Maximum de vraisemblance; loi de Poisson, essai de dénombrement par la méthode des dilutions, estimation du nombre le plus probable.

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